Trung tâm Hợp tác và Phát triển Đào tạo tiền thân là Trung tâm đào tạo Thường xuyên được thành lập theo quyết định số 290/QĐ-YHP ngày 09/10/2006 của Hiệu trưởng Trường Đại học Y Hải Phòng.
Năm 2016 Trung tâm đào tạo thường xuyên được đổi tên thành Trung tâm Hợp tác và Phát triển Đào tạo theo quyết định số 545 ngày 31/05/2016 của Hiệu trưởng Trường Đại học Y Dược Hải Phòng.